Ormanın derinliklerinde, arkadaşlarına her zaman yardım eden Eşek adında bir goril yaşar. Bir keresinde karakterimiz ormanın diğer tarafında yaşayan uzak akrabalarını ziyaret etmeye karar verdi. Super Donkey Kong 99 oyununda sizler bu macerada kahramana yardım etmek zorunda kalacaksınız. Karakteriniz önünüzdeki ekranda görünecek, sizin rehberliğinizde yol boyunca ilerleyecek ve yavaş yavaş hızlanacak. Yolda, karakteriniz her yere dağılmış muzları ve altınları toplamak zorunda kalacak. Ayrıca yolunda karşısına çıkacak çeşitli tuzakları ve engelleri aşması gerekecek.