Ball Trek Genesis Edition oyunu sizi Evrenin kökeninde durmaya davet ediyor; tüm süreç toplarla dolu bir bulmaca gibi görünecek. Aslında mavi toplar gelecekte güneş sistemini oluşturacak gezegenlerdir. Görev, bir dizi topu labirentte yönlendirerek beyaz çıkış portalına ulaşmaktır. Taşınırken pillerin toplanması gerekir ve bu bir ön koşuldur. Topların çıkmaz sokaklara sıkışmasını önlemek için E, C, Q, X tuşlarını kullanarak çeşitli komutları kullanmalısınız. Topların kontrolünü değiştirerek hem ileri hem de geri hareket etmenizi sağlayabilirsiniz. Ball Trek Genesis Edition'da her seviyede toplara yer açmak için bir yere yerleştirilmesi gereken yeni engeller eklenecek.