Free the Little Penguin'de birkaç yaramaz küçük penguen bir kafese kilitlendi. Annelerinin sözünü dinlemeyip köylülerden lezzetli bir şeyler almak için köye kaçtılar. Aptal penguenler bir kafese konuldu ve kilitlendi. Eğer onları serbest bırakmazsanız zavallı yaratıklar hayvanat bahçesine satılacak. Penguenlerin annesi çaresizlik içerisinde kafesin başında duruyor, çocuklarına yardım edemiyor ve tek umudu sizsiniz. Köylüler evlerinde dinlenirken siz de köyün içinde dolaşabilir ve Free the Little Penguin'de kafes anahtarını arayabilirsiniz.