Yeni Ninja Run oyununda, cesur bir ninjanın siparişinin başkanının görevini tamamlamasına yardımcı olmanız gerekir. Kahramanınız korunan bölgeye girmeli ve orada belirli bir zamanda görünen sihirli yıldızları toplamalıdır. Kahramanınız yol boyunca yavaş yavaş hızlanacak. Yıldızları fark ettiğiniz anda, onları toplamaya çalışın. Yolda çeşitli engeller ve tuzaklarla karşılaşacaksınız. Kahramanınızı kontrol etmek onların üzerine atlamak zorunda kalacak. Eğer tepki gösterecek zamanınız yoksa, kahramanınız ölecek ve seviyenin geçişinde başarısız olacaksınız.
