Ben bir süredir yeryüzüne zarar verebilecek uzaylıların gelişiyle ilgili herhangi bir mesaj almadı. Biraz rahatladı, ama aniden bileği Ominitrix titreşti, bu da çocuğun yeni bir görevi olduğu anlamına geliyor. Görünüşe göre bir grup uzaylı dağlara indi ve gezegende bir tür kirli hile yaratacak. Sabotajcılara hızla ulaşmak ve nötralize etmek gerekir. Kahramanın farklı kaplamalar kullanması gerekecek, ancak önce insan formunda hareket edecek, çünkü Ben 10 Alien'de bir atış kaçırmadan platformlar arasında atlamak için çeviklik gerektirecek.