Gezegenlerden birinde bulunan bir toprak kolonisinin üzerinde, garip, çok renkli baloncuklar belirdi. Anlaşıldığı üzere, zehirle dolu. Yavaş yavaş, dünyalılar kolonisine inerler. Bubble Planets oyununda hepsini yok etmeniz gerekecek. Bunun için özel bir top kullanacaksınız. Ayrıca belirli bir renge sahip tekli şarjlar çekecek. Tüm baloncukları dikkatlice incelemeniz ve belirli nesnelerin yoğunlaştığı bir yer bulmanız gerekecek. Ücretinizle aynı renkte olmalıdırlar. Bundan sonra, bir atış yapacaksınız. Bir nesne kümesine çarpan çekirdek onları patlatacak ve bunun için size belirli sayıda puan verilecek. Göreviniz, bu eylemleri gerçekleştirerek oyun alanını mümkün olan en kısa sürede tüm baloncuklardan temizlemek.