İyi huylu tesisatçı Mario'nun bir rakibi var - kurnaz ve kurnaz Vario. Herhangi bir nedenle sürekli olarak kahramanla rekabet eder. Gizlice, Mantar Krallığı'nda Mario'nun yerini güzel prenses Şeftali'ye daha yakın bir yerde almak istiyor. Geçen gün kurnaz adam, tesisatçının devam eden bir yarışma düzenlemesini önerdi. Kazanmak için, kırmızı bayrağa ulaşan ilk kişi olmanız, ustalıkla engellerin üzerinden atlamanız gerekir. Mario'ya yardım et, Vario'nun kazanmasını istemezsin. Koşarken bozuk paraları kaçırmamaya çalışın. Bu sadece altın değil, kahramanı hızlandırmanın bir yolu, cebinde bir bozuk para ile çok daha hızlı koşacak. Kahraman bir engele takılırsa, Super Mario vs Wario'nun başlangıcında geri dönecektir.