Zaman zaman, oyun kızları sihri kendi amaçları için kullanmaya meyillidir. Ancak Magical Girl Spell Factory oyununun kahramanı Yuki, sihri, onu talep eden birine yardım etmenin bir yolu olarak görüyor. Son zamanlarda, on iki karakterin oyun alanından aniden kaybolduğunu öğrendi. Kız, sihirli kitabının yardımıyla onları geri almaya karar verdi. Önce kızı onun için bir kıyafet seçerek hazırlayın ve ardından büyücülük için malzemeleri birleştirmeye başlayın. Üç öğe alın ve bunları kitaba yerleştirin. Magical Girl Spell Factory'de öğeler doğru seçilirse bir mucize gerçekleşecek ve eksik kahramanlardan biri ortaya çıkacak.