Simyacılar sahte bilim olarak kabul edilir, ancak adalet adına gerçek kimyagerlerin ortaya çıkmasına neden olduğunu söylemeye değer. Simyacıların felsefe taşını aradıklarını muhakkak biliyor ya da duymuşsunuzdur. Bu aslında bir taş değil, metali altına çevirebilen belirli bir maddedir. Math Alchemist oyunu sizi matematiksel bir simyacı olmaya davet ediyor ve sahaya düşen yuvarlak elemanlardan sadece aşağıda belirtilen miktara kadar olanlarını seçmelisiniz. Hızlı hareket etmeniz gerekiyor, çünkü Katolik top sayısı sürekli olarak yenileniyor ve Math Alchemist oyun alanının tüm alanını dolduruyor.