İnsanlığın kurtarıcısı olan ünlü çizgi film karakteri, on yaşındaki Ben Tennyson, onu diğer gezegenlerin çeşitli temsilcilerine dönüştürebilen uzaylı kökenli özel bir saat kullanabilmesi açısından diğer dünyalılara göre bir avantaja sahiptir. Ancak Ben 10 Run oyununda dönüşüm olmayacak, kahraman kendi gücüne ve dayanıklılığına güvenecek. Çeşitli engellerin üzerinden atlayarak açık bir çöl alanında koşması gerekecek. Kaçmasının nedeni kuzeni Gwen'in ortadan kaybolmasıdır. Zaman kaybetmeden her şeyi hızlı bir şekilde yapmanız gerekiyor, bu yüzden Ben 10 Run'da kahramanın engellerin üzerinden atlamasına ve kristalleri toplamasına yardım etmelisiniz.