Ben 10: Brains vs Bugs'ta komik bir yeşil uzaylıya kaçırılan arkadaşlarını kurtarması için yardım etmeniz gerekecek. Önünüzde, belirli bir konumda yer alacak olan ekranda karakteriniz görünecektir. Kontrol tuşlarını kullanarak eylemlerine rehberlik edeceksiniz. Kahramanınız, çeşitli tuzakları ve diğer tehlikeleri aşarak belirli bir rota boyunca yürümek zorunda kalacak. Yolda, Ben 10: Brains vs Bugs oyununda size puan kazandıracak ve karaktere çeşitli bonuslar verebilecek altın paraları ve diğer yararlı öğeleri toplayacak. Ayrıca karakteriniz yolu üzerinde karşınıza çıkacak böceklerle mücadele etmek zorunda kalacak.
