Jöle adam Runner Blob 3D'de başlangıçta duruyor ve siz ona onay verdiğiniz anda koşmaya hazır. Önünde, ağzına kadar çeşitli engellerle dolu bir yol var ve bunların hepsi az ya da çok jöle adam için tehdit oluşturuyor çünkü onları aşarken kendisinden bir parçayı kaybetmek zorunda kalacak. Ancak serbest koşu sırasında jöle toplarını ustaca toplarsanız kaybettiğiniz şeyi telafi edebilirsiniz. Sorun, kahramanın neden bu kadar tehlikeli bir koşuya karar verdiğidir. Ve Runner Blob 3D'de kahramanın yaşadığı dünyada kilo alabilmek için toplanması gereken mor kristallerden bahsediyoruz.