Cesur araştırmacılardan oluşan bir ekip, Bubble Throw'da dost canlısı medeniyetler bulmak için bir uzay gezisine çıkıyor. Uçuş sırasında, çok renkli baloncuklarla doldurulan ve gemiyi içeriden ele geçirmekle tehdit eden belirli bir düşman madde gemiye girdi. Kahramanlar, aynı renkli topları fırlatıp daha sonra yok etmek üzere üç veya daha fazla aynı toplardan oluşan gruplar oluşturarak istilaya karşı savaşabileceklerini öğrendiler. Bubble Throw'da bir seviyeyi tamamlamak için gerekli sayıda puanı toplamanız gerekir. Oyunda toplam elli seviye bulunuyor ve bunların karmaşıklığı giderek artıyor.
