Bazı nedenlerden dolayı, oyun alanlarına gelen uzaylıların çoğu evcil hayvanları (koyun veya inek) kaçırıyor. Paper UFO oyunu bir istisna olmayacak. Bir ineği alıp onu başka bir gezegene gönderecek özel bir portala taşımak için uçan daireyi kontrol edeceksiniz. Yabancı bir gemiye tıkladığınızda yere doğru yönlendirilmiş dikey bir ışın görünecektir. İçine bir hayvan girerse yükselmeye başlar. Bu sırada ineği hareket ettirmek için plakayı hareket ettirmeye başlıyorsunuz, tüm tehlikeli engelleri aşıyorsunuz ve Paper UFO'daki portala ulaşıyorsunuz.
