Oyunda iki yüz kırk seviye Hexa Bulmaca Master zorluk seviyelerine göre dağıtılır: Yeni başlayan, ileri, usta ve uzman. Her modda altmış seviye. Ayrıca, basitten karmaşıklığa geçmeden, karmaşık problemleri hemen çözebileceğiniz güvenine bağlı olarak herhangi bir modu seçebilirsiniz. Geçen seviyeler süreci, alanın çok kollu altıgen karoların rakamlarıyla doldurulmasıdır. Rakamlar aşağıdadır ve bunları her şeyin takılacağı ve Hexa Bulmaca Master'da serbest yer kalmayacak şekilde yerleştirmeniz gerekir.
