Alien Quarantine oyunu, yakalanan uzaylı yaratıklar üzerinde deneylerin yapıldığı gizli bir laboratuvarın topraklarında geçiyor. Uzaylılardan biri kurtulmayı başardı, diğerlerini serbest bıraktı ve laboratuvarda gerçek kaos başladı. Alien Quarantine oyununun kahramanı keşif için gönderilir ancak tehlikeli bir düşmanla karşı karşıya kalır. Canavarların diğer sektörlere girmesini önlemek için güvenlik sistemini yeniden kurması gerekiyor. Bunu yapmak için, uzaylı saldırılarından kaçan, hareket eden ve ateş eden birkaç cihazı etkinleştirmeniz gerekir.
