Mario'nun elinde gerçek bir el bombası fırlatıcı vardı, bu güçlü bir silah ve kahramanın onunla silahlanmaya karar vermesi tesadüf değildi. Zombi sürüleri onun dünyasına saldırdı. Ölüler mezarlarından kalktılar ve Mantar Krallığının platformlarını doldurmaya başladılar. Kral dehşete düşer ve tekrar tesisatçıdan herkesin bu beladan kurtulmasına yardım etmesini ister. Zombiler saldıracak gibi görünmüyor ama kim bilir yarın ne istiyorlar. Onları bulmanız ve el bombası atarak yok etmeniz gerekiyor. Patlamadan itibaren zombi parçalara ayrılacak ve artık kimseyi tehdit etmeyecek. El bombası fırlatıcı kesinlikle yıkıcı güce sahiptir, ancak dezavantajları da vardır. El bombasının hedefe yakın bir yere düşmesi gerekiyor, aksi takdirde Super Mario vs Zombies'de istenen patlama etkisi elde edilemeyecek.
