Özel kuvvetler ekibinin bir parçası olarak, Secret Oparetion'da dünya çapındaki gizli görevleri tamamlayacaksınız. Oyunun başında karakterinizi seçmeniz gerekecek. O zaman onun için silah, patlayıcı ve mühimmat alın. Bunu yaptığınız anda, kahramanınız belirli bir konumda olacaktır. Kontrol tuşları yardımıyla onun hareketlerine yön vereceksiniz. Radarı kullanarak ilerlemeniz gerekecek. Düşmanı fark ettiğiniz anda ona saldırın. Doğru ateş ederek ve el bombaları kullanarak düşman askerlerini yok edecek ve bunun için puan kazanacaksınız. Düşmanın ölümünden sonra, ondan düşen kupaları toplamayı unutmayın.