Misty adlı jöle karakteri, MystiCloned'da benzersiz bir platform dünyasında yolculuğa çıkıyor. Yolu ilginç olacak ama engelleri aşmasına yardım etmezseniz oldukça zor olacak. Bunun için kahramanın özel portallara ihtiyacı olacak. Onlardan geçen kahraman, emrinde belirli sayıda klon alacak. Kahramana benziyorlar ama siyaha boyanmışlar. Klonun belirli bir yerde durmasını istiyorsanız fare tuşuyla üzerine tıklayın, klon soluk pembeye dönecek ve yerinde kalacaktır. Kapıyı açmak için bir düğmeyi düzeltmeniz gerektiğinde buna ihtiyaç duyulacaktır. Gelecekte MystiCloned'deki çeşitli engelleri aşmak için klonları farklı şekillerde kullanmanız da gerekecek.
