Örümcek Adam'ın süper güçlerine sahip bir adam, dış istihbaratta görev yapmaya gitti ve James Bond gibi özel ajan oldu. Ama onun bir silaha ihtiyacı yok; düşmanlarıyla baş edebiliyor. Yaydan bir ağ salan ve düşmanı onunla dolaştırıp onu tamamen hareketsiz bırakan şey. Mutant Assassin 3D'de istenmeyen düşman ajanlarını ortadan kaldırarak kahramanın görevleri tamamlamasına yardımcı olacaksınız. İmha mekanizması basittir: Yeşil daireyi bir sonraki kırmızı kötü adama doğrultursunuz ve ağı serbest bırakırsınız. Bedeni sarar ve düşmanı mağlup eder. Aynı şekilde, Mutant Assassin 3D'de bölümü tamamlamak için yığınla para toplamanız gerekiyor, bunların toplanması gerekiyor.