Atom Savaşı oyununda atom dediğimiz en küçük parçacıkların yaşadığı dünyaya gideceksiniz. Bu dünyada bir savaş başladı ve sen de onun içinde yer alacaksın. Kırmızı atomunuzu önünüzdeki ekranda göreceksiniz. Belli bir büyüklüğe sahip olacak ve çevresinde küçük bir kuvvet alanı görülecektir. Atomunuzun etrafında diğer parçacıklar mavi renkte görünmeye başlayacaktır. Bunları dikkatlice incelemeniz ve karakterinizin boyutundan daha küçük olanları bulmanız gerekecek. Bu, bu parçacıkların atomunuzdan daha zayıf olduğu anlamına gelir. Onları kovalamak ve sonra saldırmak zorunda kalacaksınız. Mavi atomu yok ederek puan alacaksınız ve karakteriniz daha da büyüyecek ve güçlenecek.