Ninja Assassin'deki kahramanınız bir katil ninja ve işini yardımınızla yapacak. Şu anda düşmanları olanların yok edilmesinden oluşuyor. Aslında görev depoları temizlemektir. Onlara soymak için büyük ölçekli bir saldırı bekleniyor. Muhafızlar, fenerlerle yollarını aydınlatan kutularla odaların etrafında yürürler. Ninja fener tarafından aydınlatılan bölgede ise, gardiyan onu görecek ve ona saldıracaktır. Karanlık taraftan seçilmeli ve anında saldırmalısınız. Tüm süreç sessizdir, böylece diğer gardiyanlar Ninja suikastçısına karşı dikkatli olmaz.