Eski Japonya'da, devletin ve canavarların çeşitli düşmanlarıyla savaşan bir Ninja Savaşçısı Düzeni vardı. Bugün oyun Ninja Defender biz tapınağa girmek ve onun emri başkanı görevi yerine getirmek için bir savaş yardımcı olacaktır. Tapınağın içinden geçen kahramanımız salonlarına girecek. Çeşitli canavarlar tarafından saldırıya uğrayacak. Karakterimiz silahları bumerang gibi çok kullanacak. Onu düşmanın içine sokarak, ona çarpacağız ve sonra nesne geri dönecek. Karakteri hareket ettirmeliyiz, böylece onu itti ve böylece tekrar atışı yaptı. Bunu yapmak için zamanımız yoksa, silahı kaybeder ve turu kaybederiz.
